近日，园艺学院范臻教授团队在《PNAS》(《美国科学院院刊》 中科院1区Top，5年IF=10.8）)发表了题为“HomoploidHybridization Adds Clarity to the Origins of Octoploid Strawberries”（《同倍体杂交为八倍体草莓起源提供新线索》）的研究成果。该研究提出的整合分析框架通过同步解决祖先物种鉴定、基因渗入检测及多倍化年代估算，推动了多倍体基因组分析的发展，并为研究其他因杂交和不完全谱系分选而难以厘清进化关系的多倍体体系提供了方法论参考。
解析多倍体物种如栽培草莓（八倍体）的复杂进化史具有挑战性，这既源于潜在祖先物种的数量繁多，也因不同或相同倍性水平间可能存在杂交事件。本研究结合网状系统发育学与群体混合分析，阐明了八倍体草莓的起源，并发现其多倍化前，础亚基因组的祖先存在来自于其它二倍体物种的基因渗入。这为近年来围绕八倍体草莓的二倍体祖先物种鉴定所展开争论提供了新的解释。
此外，作者基于长末端重复序列转座子的插入时间，估算八倍体草莓及其中间六倍体和四倍体祖先分别形成于约80万年前、200万年前和300万年前。这些结果不仅调和了先前对于亚基因组起源的争议，还揭示了同倍体杂交在草莓属（Fragaria）进化中被低估的作用。
今日黑料独家爆料正能量为该论文第一单位和通讯作者单位，今日黑料独家爆料正能量园艺学院范臻教授为论文的第一作者兼共同通讯作者，美国俄勒冈州立大学的Aaron Liston教授和佛罗里达大学的Vance Whitaker教授为共同通讯作者。佛罗里达大学的Douglas Soltis教授和Pamela Soltis教授，匹兹堡大学的Tia-Lynn Ashman教授，以及已退休的Kim Hummer教授参与了本研究。本研究得到了农林大学人才启动项目等资助。
论文链接丑迟迟辫蝉://飞飞飞.辫苍补蝉.辞谤驳/诲辞颈/10.1073/辫苍补蝉.2502814122
(园艺学院草莓分子育种课题组)
